Mental Parmi les diables dans les détails sont la séquence protéase, la susceptibilité et la structure dans les virus CRF_AG

Parmi les diables dans les détails sont la séquence protéase, la susceptibilité et la structure dans les virus CRF_AG

Les études épidémiologiques de résistance aux médicaments chez les sous-types VIH ont largement porté sur les mutations génétiques gag-pol qui dépendent de la bioinformatique pour digérer et analyser les grandes bases de données sur les séquences et les protéines Kinomoto et al notent dans leur discussion qu ‘ l’établissement d’une base de données de résistance non-sous-type B pour mieux comprendre le rôle de ces mutations “[, p] À Stanford University, avec la collaboration de virologues internationaux, Rami Kantor a analysé des données de séquençage de personnes infectées. -B sous-types VIH Ce large aperçu des sous-types non-B et de la relation entre le traitement et les polymorphismes des protéases a identifié plusieurs des mêmes sites trouvés dans les présents isolats CRF_AG du Ghana étudiés par Kinomoto et al . mutations de la protéase à une faible résistance aux médicaments et l’importance de ces mutations pour la résistance phénotypique et la réponse au traitement Des études approfondies pour étudier la signification des différences inter et intrasubtypes dans les polymorphismes de la résistance à des médicaments spécifiques in vitro nécessitent des dosages phénotypiques recombinants sensibles et précis. Dans la plupart des essais phénotypiques, les gènes gag-pol du virus test ou, de préférence, clone séquencé sont insérés dans un squelette de sous-type B, et la sensibilité aux médicaments est évaluée en mesurant la réplication virale en présence de médicaments L’étude actuelle a utilisé juste une telle stratégie, mais sans comparaison avec divers isolats cliniques ou une gamme de gag sauvage En outre, dans l’évaluation des inhibiteurs de la protéase, il existe des arguments en faveur de l’inclusion de la protéine gag native dans le ou les substrats du virus recombinant pour identifier la sélection des mutations du site de clivage. pour un test de virus entier, parce que la protéase joue également un rôle de traitement important dans d’autres prod de gène du VIH uctsKinomoto et al ont effectué une modélisation moléculaire sophistiquée des relations structure-fonction pour calculer les interactions de liaison inhibiteur-ligand, en comparant différentes enzymes et inhibiteurs pouvant nécessiter certaines qualifications Une des limites de l’analyse est la tentative d’attribuer la différence significative des constantes d’inhibition. différences structurelles peuvent nécessiter une analyse structurelle plus prudente des complexes protéine-ligand Il est difficile de comprendre les relations structure / activité en jeu avec des structures médicamenteuses et / ou des polymorphes protéiques étroitement apparentés. Une deuxième limitation est la différence entre les structures calculées et les interactions et ceux déterminés empiriquement par des structures cristallines inhibiteur-enzyme Des routines de minimisation à la liaison de ligand calculée incluant celles présentées dans Kinomoto et al sont effectuées, nécessairement, avec des contraintes prédéterminées placées sur certains atomes pour limiter le temps de calcul. Les procédures de minimisation et d’amarrage suggèrent qu’une modification conformationnelle du ligand pourrait être la source de la différence de liaison entre les sous-types B et les protéases CRF_ AG avec certains inhibiteurs de la protéase dans de nombreux cas. structure de la protéase du VIH liée à des inhibiteurs relativement rigides, ce sont les chaînes latérales de la protéine et parfois l’épine dorsale qui montrent le mouvement Des différences subtiles de liaison peuvent contraster avec les énormes mouvements des proteases. La modélisation présentée dans Kinomoto et al montre seulement des différences subtiles dans la liaison Que les différences calculées dans “l’insérabilité” d’un inhibiteur dans une structure mutante peut expliquer les petites différences dans l’activité de un médicament est une question intrigante, mais qui reste hautement spéculative micrographie. Les résultats de ces études influenceront les décisions concernant les thérapies par inhibiteurs de protéase en Afrique de l’Ouest ou chez les patients infectés par le virus sous-type CRF_AG Dans une large mesure, les directives thérapeutiques antirétrovirales L’ordre des coefficients de liaison, la susceptibilité phénotypique, et une susceptibilité génotypique prédite aux inhibiteurs de la protéase actuels pour le sous-type du VIH CRF_AG sont importants. Combiné avec la tolérance aux médicaments, le fardeau de la pilule coût, et les propriétés pharmacologiques, l’activité médicamenteuse relative jouera un rôle dans l’optimisation des régimes efficaces pour répondre au défi complexe de la nécessité d’un traitement efficace contre le VIH en Afrique Il s’agit d’une enquête réfléchie sur le mécanisme de la résistance aux médicaments. traitement pro grammes dans le monde

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels DK et RO: aucun conflit